청구번호 조심2008지1058

주 문

심판청구를 기각한다.

이 유

1. 처분 개요

가. 청구인은 1995.4.27. 건설업(토목, 건축) 및 건설자재 도소매업 등을 목적사업으로 하고, 본점소재지를 서울특별시 중구 ○○○가 ○○○번지로 하여 설립된 주식회사 ○○○(이하 “청구외 종전법인”이라 한다)이 2001.12.5. 상법 제520조의2 제1항 규정에 의하여 해산으로 말소등기 되었으나, 2002.11.14. 회사계속등기를 필하고, 같은 날 상호를 변경하고 목적사업에 토지매매업 등을 추가등기 한 후, 2003.4.25. 서 울특별시 서초구 ○○○동 ○○○번지 토지 3014.6㎡(이하 “이 건 토지”라 한다)를 취득하고, 2007.4.19. 이 건 토지상에 건축물 23,556.8㎡(이하 “이 건 건축물”이라 하고, 이 건 토지를 포함하여 “이 건 부동산”이라 한다)를 신축취득한 후, 일반세율을 적용하여 산출한 등록세 등을 처분청에 각각 신고납부 하였다.

나. 처분청은 사실상 청구인의 설립일을 회사계속등기일인 2002.11.14.로 보고, 이로부터 5년 이내에 취득․등기한 이 건 부동산을 대도시내에서 법인설립일로부터 5년 이내에 취득․등기한 부동산으로 보아 이 건 부동산의 취득가액 합계액 19,263,165,822원을 과세표준으로 하고 지방세법 제138조 제1항 제3호의 중과세율을 적용하여 산출한 세액에서 기 신고납부한 등록세 등을 차감한 등록세 928,501,160원, 지방교육세 170,296,010원, 합계 1,098,797,170원(가산세 포함)을 청구인에게 2007.11.12. 부과고지 하였다.

다. 청구인은 이에 불복하여 2008.1.18. 이 건 심판청구를 제기하였다.

2. 청구인 주장 및 처분청 의견

가. 청구인 주장

1) 지방세법 제138조 제1항 제3호에서 규정하는 “법인의 설립 이후의 부동산 등기”에서 규정하고 있는 법인의 설립일은 상법에서 정하고 있는 법인설립등기일을 의미하는 것인 바, 법인이 영업활동을 하지 않더라도 법인격 자체가 소멸하지 아니하는 한 법인의 설립일은 당초 설립등기일로 보아야하므로 이 건 부동산은 법인설립등기일로부터 5년이 경과한 후 취득․등기한 것이므로 중과세 대상이 아님에도 처분청에서 이를 등록세 중과세 대상으로 보는 것은 부당하다.

2) 또 한, 이 건 부동산은 청구인이 유통시장 전면개방으로 경쟁력을 상실한 도심의 재래시장의 시설현대화를 통한 시장기능 활성화를 위하여 시장재건축사업시행구역으로 선정 받아 장기간 소요된 사업진행으로 상당한 손실을 초래한 끝에 현대화시설로 사업 완료한 것임을 감안하면 이 건 등록세 중과세 처분은 취소되어야 한다.

나. 처분청 의견

지방세법 제138조 제1항 제3호에서 규정하고 있는 대도시내 에서의 법인의 설립은 반드시 등기형식이 설립등기가 있는 경우만 한정하지 아니하고, 청구인의 경우와 같이 변경등기의 형식을 취하였더라도 실질적으로 회사의 설립등기와 같은 것으로 볼 수 있는 등기가 있는 경우도 포함하는 것이 실질과세원칙에 부합하므로 청구인의 경우와 같이 상법 제520조의2 제1항의 규정에 의하여 해산 등기된 청구외 종전법인을 2002.11.14. 회사 계속등기를 하고 같은 날 상호, 본점, 목적사업 등을 변경한 사실 등을 볼 때, 이는 이 건 종전법인과는 경제적 실질을 달리하고 있는 것으로서 회사계속 등기일이 청구인이 실질적으로 설립된 날이라 할 것이므로 이로부터 5년 이내에 취득한 이 건 부동산에 대하여 지방세법 제138조 제1항 제3호의 등록세 중과세율을 적용하여 산출한 등록세 등을 부과고지한 처분은 잘못이 없다.

3. 심리 및 판단

가. 쟁 점

대도시내에서 설립된지 5년 이상된 휴면법인을 인수한 후 회사계속등기 및 상호 등을 변경 등기하고 부동산을 취득 등기한 경우, 회사계속등기일을 법인설립일로 보아 이로부터 5년 이내 취득․등기한 부동산에 대하여 등록세를 중과세(일반세율의 3배)하는 것이 적법한지 여부

나. 관련 법령

(1) 지방세법 제124조(납세의무자) 등록세는 재산권 기타 권리의 취득·이전·변경 또는 소멸에 관한 사항을 공부에 등기 또는 등록(등재를 포함한다. 이하 같다)하는 경우에 그 등기 또는 등록을 받는 자에게 부과한다.

(2) 지방세법 제138조(대도시 지역내 법인등기등의 중과) ① 다음 각호의 1에 해당하는 등기를 하는 때에는 그 세율을 제131조 및 제137조에 규정한 당해 세율의 100분의 300으로 한다.

3. 대도시내에서의 법인의 설립과 지점 또는 분사무소의 설치 및 대도시내로의 법인의 본점·주사무소 지점 또는 분사무소의 전입에 따른 부동산등기와 그 설립·설치·전입 이후의 부동산등기

(3) 지방세법 시행령 제102조(대도시내 법인등 중과세의 범위와 적용기준) ② 법 제138조제1항제3호에서 "법인의 설립과 지점 또는 분사무소의 설치 및 대도시내로의 법인의 본점·주사무소·지점 또는 분사무소의 전입에 따른 부동산등기"라 함은 당해 법인 또는 지점 등이 그 설립·설치·전입이전에 취득하는 일체의 부동산등기를 말하며, "그 설립·설치·전입이후의 부동산등기"라 함은 법인 또는 지점 등이 설립·설치· 전입이후 5년이내에 취득하는 업무용·비업무용 또는 사업용·비사업용을 불문한 일체의 부동산등기를 말한다. 이 경우 일체의 부동산등기에는 공장의 신설·증설, 공장의 승계취득, 당해 대도시내에서의 공장의 이전 및 공장의 업종변경에 따르는 부동산취득등기를 포함하며, "지점등"이라 함은 행정자치부령이 정하는 사무소 또는 사업장을 말한다.

(4) 상법 제172조(회사의 성립) 회사는 본점소재지에서 설립등기를 함으로써 성립한다.

(5) 상법 제434조(정관변경의 특별결의) 제433조제1항의 결의는 출석한 주주의 의결권의 3분의 2 이상의 수와 발행주식총수의 3분의 1 이상의 수로써 하여야 한다.

(6) 상 법 제520조의2(휴면회사의 해산) ① 법원행정처장이 최후의 등기후 5년을 경과한 회사는 본점의 소재지를 관할하는 법원에 아직 영업을 폐지하지 아니하였다는 뜻의 신고를 할 것을 관보로써 공고한 경우에, 그 공고한 날에 이미 최후의 등기후 5년을 경과한 회사로서 공고한 날로부터 2월 이내에 대통령령이 정하는 바에 의하여 신고를 하지 아니한 때에는 그 회사는 그 신고기간이 만료된 때에 해산한 것으로 본다. 그러나 그 기간내에 등기를 한 회사에 대하여는 그러하지 아니하다.

③ 제1항의 규정에 의하여 해산한 것으로 본 회사는 그 후 3년 이내에는 제434조의 결의에 의하여 회사를 계속할 수 있다.

④ 제1항의 규정에 의하여 해산한 것으로 본 회사가 제3항의 규정에 의하여 회사를 계속하지 아니한 경우에는 그 회사는 그 3년이 경과한 때에 청산이 종결된 것으로 본다.

다. 사실관계 및 판단

(1) 청구외 종전법인은 1995.4.27. 본점소재지를 서울특별시 중구 ○○○가 25-52번지로, 목적사업을 건설업(토목, 건축), 건설자재 도소매업, 인테리어, 위 부대사업일체로 하여 설립되었고, 2001.12.5. 상법 제520조의2 제1항의 규정에 의하여 해산되었으며, 2002.11.14. 회사 계속등기를 필하였고, 같은 날 대표이사 등 임원진 전부와 본점소재지를 서울특별시 서초구 ○○○동 ○○○지 ○○○빌딩 304호로 변경하였으며, 목적사업에 토지개발업 및 부동산매매, 분양 및 임대업 등을 추가하였고, 2003.4.25. 이 건 토지를 취득하여 이전등기를 필하였으며, 2007.4.19. 이 건 건축물을 취득한 후, 2007.8.1. 보존등기를 필한 사실을 알 수 있다.

(2) 지방세법 제138조 제1항 제3호 및 같은 법 시행령 제102조에서 “대도시내에서의 법인의 설립”이란 설립등기에 의한 설립만을 지칭한다기 보다는 법인의 실질적인 설립행위를 포함하는 것으로 해석할 수 있고, 같은 항 제2호에서도 대도시 내로의 법인 본점 등의 전입은 법인의 설립으로 보아 같은 세율을 적용한다고 규정하는바, 전입과 설립이 동격으로 나란히 규정되어 있는 형태에 비추어 보더라도, 설립은 “설립등기에 의한 설립”이라기보다 법인의 실질적인 설립행위 자체를 가리키는 것으로 보는 것이 더 자연스럽다 판단된다.

(3) 지방세법 제138조에 따른 등록세 중과대상이 되는 경우에는 대통령령이 정하는 날부터 30일 이내에 중과세율을 적용한 세액에서 이미 납부한 세액을 공제한 금액을 신고 납부하도록 하면서 같은 법 시행령 제104조의2제2항제1호에서 법인을 신설하는 경우에는 당해 사무소 또는 사업장이 사실상 설치된 날을 그 기산점으로 정하고 있는 바, 위 규정은 부동산 취득․등기 이후에 법인이 설립되는 경우에는 사무소 또는 사업장의 사실상 설치와 같은 실질적인 설립행위를 기준으로 설립 여부를 판단하여 등록세 중과여부를 결정하도록 정한 것이라고 할 수 밖에 없 다고 할 것이고, 세법의 규율대상인 경제현상이 다양하고 끊임없이 변화함에 비추어 입법기술상 어느 정도 다의적인 개념의 사용과 그에 대한 해석행위는 과세에 불가피 한 것이며, 법 제138조의 입법취지를 고려하면 위 설립에는 설립등기 없이 실질적인 설립행위만이 있는 경우도 포함된다고 해석함이 상당하고, 위와 같은 해석이 조세법률주의에 위반되는 확장해석 내지 유추해석이라고는 보이지 아니하는 것(서울고등법원 2007.12.4.선고 2007누12691 참조)으로 판단된다.

(4) 청구인의 경우 상법 제520조의2 제1항의 규정에 의하여 해산등기 된 청구외 종전법인을 2002.11.14. 회사계속등기를 하고, 같은 날 본점소재지, 임원진 및 목적사업을 변경한 사실을 볼 때, 비록, 청구인이 회사 설립등기를 하지 않고 기존 회사를 인수함으로써 당초 청구외 종전법인의 법인격이 유지되었다 하더라도 청구외 종전법인의 본점소재지, 목적사업, 임원 등을 변경함으로써 청구외 종전법인과 청구인은 동일성을 찾을 수 없을 정도로 변경되었다고 볼 수 있고 따라서 이는 회사인수 후 변경등기의 형태를 취하였다 하더라도 새로운 회사가 설립된 것과 실질적으로 차이를 찾을 수 없으므로 청구외 종전법인의 회사 계속 등기를 한 날인 2002.11.14. 청구인의 실질적인 설립행위가 있었다고 할 것인 바, 이날부터 5년 이내인 2003.4.25. 및 2007.4.19. 이 건 부동산을 각각 취득하여 소유권이전등기를 필한 것은 지방세법 제138조제1항제1호 및 제3호 와 같은 법 시행령 제102조 제2항에서 규정하고 있는 법인 설립 이후 5년 이내에 취득한 부동산을 등기한 것에 해당한다 할 것이므로 청구인의 주장은 받아들이기 어렵다고 판단된다.

따라서, 처분청이 청구인에게 이 건 등록세 등을 과세한 처분은 잘못이 없다고 판단된다.

4. 결 론

이 건 심판청구는 심리결과 청구인의 주장이 이유 없으므로 지방세법 제77조제5항과 국세기본법 제81조 및 제65조제1항제2호의 규정에 의하여 주문과 같이 결정한다.